Ef doktorsnám er skipulagt sameiginlega með öðrum háskóla skal gerður um það sérstakur samningur. Þess er gætt að námið uppfylli sambærilegar gæða- og námskröfur og gerðar eru við Háskóla Íslands og að ábyrgð á gæðum námsins sé skýr.
Miðstöð framhaldsnáms fer yfir og heldur utan um sértæka samstarfssamninga um doktorsnám.
Árið 2020 er Háskóli Íslands með virka samstarfsamninga um tvöfaldar doktorsgráður við eftirfarandi skóla:
| Samstarfsskóli | Land | Deild | Fræðasvið |
|---|---|---|---|
| Fróðskaparsetur Føroya | Færeyjar | Þjóðfræði | Félagsvísindasvið |
| Københavns Universitet | Danmörk | Lagadeild | Félagsvísindasvið |
| Universidad Complutense de Madrid | Spánn | Mála- og menningardeild | Hugvísindasvið |
| Universiteit Utrecht | Holland | Íslensku- og menningardeild | Hugvísindasvið |
| MF vitenskapelig høyskole | Noregur | Guðfræði- og trúarbragðafræðideild | Hugvísindasvið |
| Vrije Universiteit Brussel | Belgía | Sagnfræði- og heimspekideild | Hugvísindasvið |
| Sorbonne Université | Frakkland | Mála- og menningardeild | Hugvísindasvið |
| Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées | Frakkland | Mála- og menningardeild | Hugvísindasvið |
| Ludwig Maximilian Universität München | Þýskaland | Íslensku- og menningardeild | Hugvísindasvið |
| Université de Strasbourg | Frakkland | Íslensku- og menningardeild | Hugvísindasvið |
| Université Lumière Lyon 2 | Frakkland | Sagnfræði- og heimspekideild | Hugvísindasvið |
| Aarhus universitet | Danmörk | Læknadeild | Heilbrigðisvísindasvið |
| Lunds universitet | Svíþjóð | Læknadeild | Heilbrigðisvísindasvið |
| Université Clermont Auvergne | Frakkland | Líf- og umhverfisvísindadeild (heimadeild) | Umhverfis- og auðlindafræði |
| Stockholms universitet | Svíþjóð | Jarðvísindadeild (heimadeild) | Umhverfis- og auðlindafræði |
| Stockholms universitet | Svíþjóð | Stjórnmálafræðideild (heimadeild) | Umhverfis- og auðlindafræði |
| Stockholms universitet | Svíþjóð | Líf- og umhverfisvísindadeild (heimadeild) | Umhverfis- og auðlindafræði |
| Universität für Bodenkultur Wien | Austurríki | Líf- og umhverfisvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| Durham University | Bretland | Jarðvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| ITMO University | Rússland | Raunvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| University of Helsinki | Finnland | Jarðvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| University of Turku | Finnland | Jarðvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| Lanzhou University | Kína | Jarðvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| Aalto University | Finnland | Umhverfis- og byggingarverkfræðideild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| University of Colorado Boulder | Bandaríkin | Jarðvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| Universität Ulm | Þýskaland | Raunvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |
| Universidade de Aveiro | Portúgal | Raunvísindadeild | Verkfræði- og náttúruvísindasvið |