Háskólaráð skipar fimm menn í stjórn Miðstöðvar framhaldsnáms. Stjórnin er skipuð fulltrúum fræðasviða háskólans og eru þau forstöðumanni til ráðuneytis. Forstöðumaður miðstöðvarinnar er formaður stjórnar. Einn fulltrúi frá Landbúnaðarháskóla Íslands situr í stjórninni.
Stjórn Miðstöðvar framhaldsnáms 2026-2029 skipa:
Rögnvaldur Jóhann Sæmundsson, formaður stjórnar, prófessor við Iðnaðarverkfræði-, vélaverkfræði- og tölvunarfræðideild, og aðstoðarrektor vísinda og þverfræðileika við Háskóla Íslands
Tinna Laufey Ásgeirsdóttir, prófessor við Hagfræðideild, tilnefnd af Félagsvísindasviði
Þórarinn Guðjónsson, prófessor við Læknadeild, tilnefndur af Heilbrigðisvísindasviði
Eiríkur Smári Sigurðarson, rannsóknadósent og rannsóknastjóri, tilnefndur af Hugvísindasviði
Íris Ellenberger, prófessor við Deild faggreinakennslu, tilnefnd af Menntavísindasviði
Guðmundur Freyr Úlfarsson, prófessor við Umhverfis- og byggingaverkfræðideild, tilnefndur af Verkfræði- og náttúruvísindasviði
Jón Grétar Sigurjónsson, kennsluforseti, fulltrúi Landbúnaðarháskóla Íslands
Piergiorgio Consagra, fulltrúi doktorsnema, tilnefndur af FEDON - Félag doktorsnema og nýdoktora við Háskóla Íslands